Die Familie der Liliengewächse war zu Zeiten der traditionellen Familieneinteilung von Cronquist 1981 viel umfangreicher als heute. Die neuere Familieneinteilung nach dem APG-System hat die große heterogene Familie der Liliengewächse in mehrere kleinere Familien aufgespalten:
- Die Gattungen Asparagus (Spargel), Aphyllanthes (Binsenlilie), verschiedene Hyazinthen wie z.B. Hyazinthus, Hyacinthoides (Hasenglöckchen) und Bellevalia, Convallaria (Maiglöckchen), Maianthemum (Schattenblümchen), Dipcadi (Schweifblatt), Muscari (Traubenhyazinthen), Ornithogalum (Milchstern), Paradisea (Paradieslilie), Polygonatum (Salomonsiegel), Ruscus (Mäusedorn), Scilla und Verwandte (Blaustern) und Drimia (Meerzwiebel) werden nun unter der Familie der Asparagaceae (Spargelgewächse) geführt. Zu ihnen gehören nun auch die früheren Agavengewächse (Agavaceae) mit z.B. den Gattungen Agave, Dracaena und Yucca. 
- Die Gattungen Asphodelus (Affodil), Asphodeline und Hemerocallus (Taglilie) gehören zur Familie der Asphodelaceae (Affodilgewächse). 
- Die Gattung Narthecium (Beinbrech) wird in die kleine Familie der Nartheciaceae (Moorliliengewächse) abgespalten. 
- Die Gattungen Veratrum (Germer) und Paris (Einbeere) werden der Familie der Melanthiaceae (Germergewächse) zugeteilt. 
- Die Gattung Smilax (Stechwinde) bildet die Familie der Smilaceae (Stechwindengewächse). 
- Die Familie der Colchiaceae (Zeitlosengewächse) wird von den Gattungen Colchicum (Zeitlose) und Merendera (Lichtblume) gebildet. 
- Die Gattung Allium (Lauch) wandert in die Familie Amaryllidaceae (Narzissengewächse), zu der traditionell bereits u.a. die Gattungen Narcissus (Narzisse), Galanthus (Schneeglöckchen), Leucojum (Knotenblume), Pancratium (Trichternarzisse) und Sternbergia (Goldbecher) gehörten. 
- In der nun klein gewordenen Familie der Liliaceae (Liliengewächse) verbleiben nach APG nur Lilium (Lilie), Tulipa (Tulpe), Gagea (Gelbstern), Fritillaria (Schachblume), Erythronium (Zahnlilie) und Streptopus (Knotenfuß).